寛永16年。動乱の時代を生きる三代目・服部半蔵は、両親を失い餓鬼のように育ってきたアオイと楓の姉妹に目をつけ、くノ一として調教することを決意する。伊賀流を伝承するタカのもとで性を操る忍術を体得したふたりは、やがて幕府の転覆を図る由比正雪の暗殺を命じられる。だが正雪に接近した楓は、逆に彼を愛してしまう。
