あのハイジャック事件から約2か月。対テロ傭兵組織「ミスリル」に所属する宗介は、千鳥かなめの護衛として高校生活を続けていた。しかしそんなある日、「ミスリル」が持つ最新鋭潜水艦の女性艦長・テッサを狙い、新たなテロ組織・A21が暗躍を始めた。
