周囲から「ねずみ先生」と呼ばれる32歳の根須幹夫（声：細谷佳正）は、ある日突然、謎の機関によってサイボーグに改造されてしまう。同棲していた彼女が死んでから2年、冴えない人生を送っていた彼は、この日から“マウスマン”として第二の人生を生きることになる。そんななか、未知の侵略者との戦いに巻き込まれていくマウスマン。やがて、愛する者のために戦い、傷つきボロボロになった彼はある一つの決断をする……。
