日本で製作された「ゴジラ」を、新たなカットを入れて再編集したアメリカ版作品。核実験による突然変異で、巨大な怪獣ゴジラが現代に蘇った。ゴジラの前にはいかなる兵器も無効、首都はゴジラの吐く放射能によって焦土と化していく。そんなおり天才的な科学者、芹沢博士によって最終兵器オキシジェン・デストロイヤーが発明された。しかし芹沢博士は、核の二の舞を恐れ、オキシジェン・デストロイヤーの使用に反対する……。