「モータルコンバット」で魔人を退け、地球は平穏を取り戻したはずだった。ところがルールは破られ、皇帝シャオ・カーン率いる魔界の一味が、人間界への扉を開いて姿を現す。リュウ・カンやソニアらは、人類を守るべく再び戦いに立ち上がるが…。
